A carreira de Marcos Lisboa inclui experiências na academia, governo e como executivo em institutos financeiros. Hoje ele é o presidente do Insper, uma das principais escolas de negócios e economia sem fins lucrativos do Brasil.
De 2013 a abril de 2015, ele atuou em seu vice-presidente. De 2006 a 2009, foi Diretor Executivo do Itaú Unibanco e Vice-Presidente de 2009 a 2013. De 2005 a 2006, foi Presidente do Instituto de Resseguros do Brasil e atuou como Secretário de Política Econômica no Ministério da Fazenda a partir de 2003 até 2005.
Marcos foi Professor Assistente de Economia na Escola de Pós-Graduação em Economia da Fundação Getúlio Vargas (FGV) entre 1998 e 2002. Anteriormente, foi Professor Assistente de Economia no Departamento de Economia da Universidade de Stanford (de 1996 a 1998). Marcos é Ph. D em Economia pela Universidade da Pensilvânia.